Unité de Recherche : Unité de Biologie Structurale Computationnelle
Institut Pasteur
Département de Biologie Structurale et Chimie
25-28 rue du Dr. Roux
75015 Paris
Spécialité : Biologie structurale, Modélisation moléculaire
Directeur de l’unité de rattachement : Paola ARIMONDO
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Responsable de l’équipe de recherche
BONOMI Massimiliano
Courriel : mbonomi@pasteur.fr
Tél. : 01 44 38 93 63
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Composition de l’équipe de recherche :
- BONOMI Massiliano (DR, HDR)
- HYUNH Tru (IR)
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5 publications récentes de l’équipe
P. Panei, P. Gkeka, M. Bonomi. Identifying small-molecules binding sites in RNA conformational ensembles with SHAMAN. Nat. Commun. 15 (2024) 5725.
S.E. Hoff, F.E. Thomasen, K. Lindorff-Larsen, M. Bonomi. Accurate model and ensemble refinement using cryo-electron microscopy maps and Bayesian inference. PLoS Comput. Biol. 20 (2024) e1012180.
Posani, P. Janoš, D. Haack, N. Toor, M. Bonomi, A. Magistrato, G. Bussi. Ensemble refinement of mismodeled cryo-EM RNA structures using all-atom simulations. Nat. Commun. 16 (2025) 4549.
Schnapka, T. I. Morozova, S. Sen, M. Bonomi. Atomic resolution ensembles of intrinsically disordered proteins with Alphafold. bioRxiv (2025) doi: 10.1101/2025.06.18.660298. Nat. Commun. In press
F.P. Panei, R. Torchet, H. Menager, P. Gkeka, M. Bonomi. HARIBOSS: a curated database of RNA-small molecules structures to aid rational drug design. Bioinformatics 38 (2022) 4185.